Одной из сложностей, возникающих в процессе лечения случаев с лекарственно-устойчивым туберкулезом, являются нежелательные явления при приеме ТБ препаратов. При некоторых сопутствующих заболеваниях, например сахарном диабете, заболеваниях ЖКТ, почек, печени, психических расстройствах, выше риск возникновения неблагоприятных побочных реакций противотуберкулезных препаратов. Во время химиотерапии для предотвращения неблагоприятных побочных реакций проводят клинический, лабораторный и инструментальный мониторинг в зависимости от назначенных лекарственных препаратов. 
 

Необходимо помнить, что: 
Некоторые нежелательные явления могут представлять угрозу для жизни пациента, если их своевременно не диагностировать и не купировать. Также если неблагоприятные побочные реакции не купируются должным образом, существует высокий риск отрыва от лечения и неудачи в лечении. 
Во всех случаях в первую очередь должны быть исключены и устранены другие причины (соматические и инфекционные заболевания), которые могли бы вызвать подобные проявления.
Если свести к минимуму побочные эффекты применения лекарств, больной с большей вероятностью будет придерживаться режима лечения.
Нежелательные явления, в зависимости от степени тяжести, делятся на две группы, легкие и тяжелые. 

Среди легких нежелательных явлений отмечаются следующие нежелательные явления: 

• Изменения цвета мочи 

• Тошнота, иногда рвота, неприятные ощущения в животе, жидкий стул 

• Усталость 

• Легкая кожная сыпь, зуд 

​

Больного, страдающего от легких нежелательных явлений, нужно морально поддержать и не дать прекратить лечение. Врач может найти способы облегчить страдания больного, например, изменить время приема лекарства, диету больного, и/или предложить ему мягкие противорвотные средства, антациды или антигистаминные препараты. 

Лечение обычно прекращают, если у больного проявляется любой из нижеперечисленных тяжелых нежелательных явлений: 

• Неукротимая рвота 

• Признаки отравления печени/желтуха

• Периферическая невропатия 

• Сильная сыпь

​

Лечение нужно на некоторое время прервать, чтобы дать больному возможность оправиться от последствий применения препаратов, а затем снова начать давать противотуберкулезные препараты, но по одному, чтобы выявить проблемное лекарство. Когда выяснится, на какой препарат у больного такая тяжелая реакция, его следует заменить на альтернативный. Это не означает, что длительность лечения увеличивается.